A mí me pasí. El dolor de tendón de Aquiles es típico cuando empiezas. La razón es que es una parte que ejercitas mucho al patear, pero que no se ejercita tanto en otros deportes.
Solución, no sobrecargarlo (no seguir si te duele mucho) y fortalecer la zona con ejercicios de tobillo. Antes de empezar siempre calentar con movimientos de tobillo, pero nunca estirar fuerte. Estirar es recomendable al acabar. Hasta que se acostumbre la zona y se fortalezca puedes darte crema antinflamatoria como Traumel.