Sí, estoy con los de arriba: yo voto por separar sólo la sección de compra-venta.
Me gusta saber qué se cuece en todos los temas de un vistazo y luego entro en lo que me llama la atención o me interesa. A priori me parece más torpe, menos funcional y poco práctico lo de separar por temas. A casi todos nos interesan varios temas y tener que ir visitando secciones para revisar las novedades de cada uno parece se me antoja más trabajoso.
Por otro lado, las etiquetas sirven para ir a los temas que nos interesan con facilidad. También creo que en este foro la gente es bastante certera a la hora de poner título a sus posts, y que es raro que viendo el título te lleves a engaño sobre el contenido.
A mí me gusta como está, separando compra-venta, pero si hay que hacer el cambio, prefiero la opción por temas. Como dice Burru, separar por modalidades dará lugar a repetir cuestiones, ya que casi todos los temas son comunes a todas las modalidades.